在《梦幻西游》中,门派可以按照不同的种族分为三大基本类别,即掌管各大仙宫位置的仙族、拥有不同法术技能的人族和与各种危险地点有关的魔族。各个宗门的人都成立了自己的门派,即使在同一个宗门下,各宗门使用的技能也有很大的区别。目前,游戏中每个种族下都有四个门派,大致可以分为封印门派、法术攻击门派、物理攻击门派和辅助门派。
首先是掌管天宫的门派,该门派属于封印类但不精通所以也被称为半封印类门派,该门派所有人物使用的技能主要是利用目标命中后吸取对方的魔法值,最顶级也是最强大的技能叫做五雷轰顶,在战斗中使用该技能可以对命中的目标进行扣血,还可以转换目标所拥有的魔法师 最强大的技能叫做五雷轰顶。其次是精通各种法术的位于芳村山的人类门派,该门派从大类划分上也属于封神系统,在这个门派中最突出的特点是所有人物都掌握了各种不同的法术,使用法术技能击中敌方人物可以降低对方的各种物理类防御能力,并且在一定情况下有一定几率可以触发催眠的控制效果。最后,魔族中还有一个特殊的全女性教派--盘丝洞,也属于封印系,但她们不仅可以降低对方的物理型防御能力,还可以降低对方的法术型防御能力。